1. 序列組裝與編輯

SeqMan NGen：這是DNAStar軟件中用于下一代測序（NGS）數據組裝的模塊。它支持多種測序平臺的數據，能夠自動將原始的測序讀段（reads）組裝成連續的序列（contigs）或完整的基因組序列。

EditSeq：提供直觀的序列編輯器，允許用戶手動編輯、注釋和格式化DNA、RNA或蛋白質序列。

2. 序列比對與分析

MegAlign：該模塊支持多序列比對，可以將多個序列進行對齊，以便進行進一步的進化分析、突變檢測或功能預測。MegAlign提供了多種比對算法和參數設置選項，以滿足不同用戶的需求。

GeneQuest：用于在DNA序列中查找和預測基因。它利用特定的算法和模型來識別編碼區（CDS）、啟動子、終止子等基因結構元件。

5. 可視化與數據展示

SeqBuilder：作為序列可視化工具，SeqBuilder允許用戶以圖形化的方式查看和編輯序列。用戶可以創建自定義的序列視圖，添加注釋、標簽和顏色編碼等，以便更直觀地理解序列的結構和功能。

MapDraw：用于繪制和編輯限制性酶切圖譜、電泳圖等。它支持多種類型的圖譜繪制，包括線性圖譜、環狀圖譜等，并允許用戶自定義圖譜的樣式和布局。

6. 數據管理與整合

DNAStar軟件還提供了數據管理和整合的功能，允許用戶將多個序列、分析結果和注釋信息整合到一個數據庫中，以便進行統一管理和查詢。這有助于用戶更好地組織和利用生物學數據資源。